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云算GPM DNA混合图谱分析系统混合DNA混合图谱拆分-混合图谱拆分LR值计算2-5人混合图谱拆分

云算GPM DNA混合图谱分析系统混合DNA混合图谱拆分-混合图谱拆分LR值计算2-5人混合图谱拆分

云算GPM,全连续法混合图谱分析系统,基于国际主流 MCMC 算法,支持2-5人混合图谱的拆分,并提供统计学权重LR值的计算。系统开发严格按照SWGDAM和ISFG的规范进行,经过超百万的案件数据分析验证,普遍应用于欧洲、澳洲、亚洲等多国法医 DNA 实验室。

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产品配置:

云算GPM DNA混合图谱分析系统,采用C/S(Client/Server,客户端/服务器)架构。整套系统由客户端分析电脑和数据库存储服务器组成,客户端实现数据的智能化拆分和数据录入、检索功能,服务器实现案件数据的专业化存储和管理。标准配置包含2个客户端和1个服务器,2个人员可同时进行数据的判读和拆分。客户端数量不设上限,可以形成多客户端共享同一个数据库的形态,便于海量DNA混合数据的拆分、入库和核对,并可建立混合DNA数据库,为全自动海量混合数据的分析、比对做基础。

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DNA混合图谱分型技术谈(四)—贡献者数量的推断
混合DNA概率分析软件究竟该如何应用?

常见问题Q&A

1、支持哪些试剂盒的拆分?
云算GPM标准配置支持ABI,QIAGEN,PROMEGA等国际主流常染色体STR试剂盒的数据拆分。同时,国产试剂盒以及一些小众试剂盒的数据也可以通过将Panel和Bin导入系统,来进行数据的拆分。


2、软件分析速度怎么样?
2人混合数据一般在5分钟之内可以分析完成,3人混合数据一般十几分钟完成。具体分析时间会根据图谱的质量、复杂程度以及已知信息等有所不同。


3、不确定贡献者数量怎么拆分?
云算GPM系统内置的概率分型软件除了可以手动输入混合人数外,也支持软件自动计算混合人数。软件内置了根据最 大等位基因数和最 大似然估计法两种方法计算混合人数的功能,客户可根据需要选择计算方法。一般3人以上的混合人数计算,最 大似然估计法更准确。


4、是否经过SWGDAM验证?
云算GPM内置的概率分型软件在开发完成后,已经根据SWGDAM概率分型软件验证指南以及ISFG DNA委员会关于法医遗传学生物统计学软件的验证建议进行了充分的验证。软件已经按照标准要求对其灵敏度、特异性和生物模型执行精度进行了验证。并且软件已经在欧洲各国广泛应用,已经有上百万个真实案件分析的经验。


5、最多可以做几个人的拆分?
支持2-5人混合样本的拆分。


6、拆分结果是否可以做为证据使用?
目前在国外对混合图谱解释是有标准或者指南的,例如SWGDAM、FBI、German Stain Commission等都对DNA图谱解释有建议或指南,也都要求证据图谱在发生匹配或者给出包含结论的时候要有统计学解释,才能作为法庭证据采纳。
据我们所知,国内目前还没有具体的标准文件可以参考。但国内专家正在广泛地调研取证,我们也会积极地配合相应的工作,希望在不久的将来就会有相应的指南文件发出。


7、标配配置包含哪些?
云算GPM标准配置1个服务器和2个客户端,服务器中安装数据存储数据库,2个客户端分别安装有一套独立的分析软件,可满足两人同时分析。


8、对混合分型峰值有要求吗?
云算GPM是全连续法概率分型系统,对混合图谱进行拆分时综合考虑峰高、stutter峰、drop-in/out的可能性、扩增不均衡性等信息,针对因拷贝检材造成的位点丢失的图谱,也可综合考虑多次平行扩增的结果,进行统一的数据分析,对质量较差的图谱做出科学的合理解释。

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